中国科学院基因组研究所自成立以来始终致力于基因组学及相关领域的前沿研究，其博士研究生招生专业体系充分体现了学科交叉融合与前沿技术突破的导向性。2023年招生目录显示，研究所共开设生物信息学、基因组学、精准医学、合成生物学、农业基因组学、生物信息学与计算生物学、生物技术与生物工程等7个招生专业，其中生物信息学与计算生物学新增为自主命题专业方向。

在招生规模方面，各专业计划招生人数保持在15-25人区间，其中精准医学与合成生物学方向因与临床医学研究所、深圳先进院等单位的联合培养机制，实际录取人数较常规专业高出30%。值得关注的是，所有专业均要求申请者具备分子生物学、生物化学或计算生物学相关研究经历，其中农业基因组学专业明确要求申请者具有作物遗传育种或基因组编辑技术实操经验。

研究方向设置呈现显著的专业纵深特征。基因组学方向重点布局单细胞测序技术、表观基因组学与转录组学解析，要求申请者掌握Illumina NovaSeq或Oxford Nanopore测序平台操作技能；精准医学方向新增肿瘤异质性研究、免疫治疗靶点挖掘等子方向，与301医院、协和医院建立数据共享机制；合成生物学方向则聚焦人工细胞器构建、基因回路设计，要求具备CRISPR-Cas12a或Prime Editing技术基础。

培养体系突出"双导师+项目制"模式，所有博士生需在入学前6个月内完成实验室轮转，通过3个研究方向的技术考核。特别设立的"基因组大数据分析"专项计划，为通过筛选的申请者配备HPC集群算力支持，并优先推荐参与国家基因组科学数据中心建设。2022届毕业生中，32%进入全球TOP50高校从事博士后研究，19%进入跨国药企担任研发主管。

申请材料审核实施"三审三校"机制，除常规的学历证明、科研成果外，重点审查实验设计文档与代码仓库（GitHub/Gitee）的代码规范度。2024年新增英文面试环节，要求申请者现场演示分析流程并回答交叉学科问题。建议申请者提前3个月联系意向导师，重点探讨近两年在《Nature Genetics》《Cell Systems》等期刊发表的前沿成果。